Indholdsfortegnelse:

Hvorfor er det nødvendigt at oprense PCR-produkter før sekventering?
Hvorfor er det nødvendigt at oprense PCR-produkter før sekventering?

Video: Hvorfor er det nødvendigt at oprense PCR-produkter før sekventering?

Video: Hvorfor er det nødvendigt at oprense PCR-produkter før sekventering?
Video: Proper PCR Cleanup before Sanger Sequencing - Seq It Out #12 2024, Kan
Anonim

Verifikation af det ønskede produkt er vigtig , hvilket omfatter bekræftelse af mangel på uspecifikke Produkter og primerdimere. Ren -up af reaktionsblandingen er også nødvendig at fjerne ikke-inkorporerede primere og dNTP'er, der kan interferere med efterfølgende reaktioner og føre til en ulæselig sekvens.

Desuden, hvorfor er det nødvendigt at rense PCR-produkter?

Du skal rense PCR-produkter at slippe af med ubrugte primere, nukleotider og enzymer for at optimere ligeringens succes, hvilket vil opretholde og sekventere produkt af PCR . Til rense det PCR produkter , anvendes størrelsesudelukkelseskromatografi.

Man kan også spørge, skal man oprense PCR-produkter før restriktionsendonukleasefordøjelse? Størstedelen af begrænsning enzymer er aktive i PCR buffere. Til kloningsapplikationer, oprensning af PCR-produkter før fordøjelse er nødvendig at fjerne den aktive termofile DNA-polymerase, der er til stede i PCR blanding. DNA-polymeraser kan ændre enderne af det spaltede DNA og reducere udbyttet af ligering.

Folk spørger også, hvordan forbereder du PCR-produkter til sekventering?

Direkte sekventering af PCR-produkter

  1. Sørg for at forstærke det rigtige fragment.
  2. Du skal fjerne alle resterende PCR-primere og ikke-inkorporerede nukleotider.
  3. Hvis PCR-primerne også vil være sekventeringsprimerne, skal du sørge for, at de matcher vores betingelser.
  4. Overkoncentrer ikke prøven!

Kan du sekvensere PCR-produkt?

Direkte Sekvensering af PCR produkter . Sekvensering kun bruger en primer i stedet for de to brugt i PCR . Hvis du gør ikke fjerne begge primere, du vil få to sekvenser overlejret på hinanden, som ikke er læsbare. Det er OK at bruge en PCR primer til sekventering så længe det matcher vores betingelser.

Anbefalede: